Der Baptisterium wurde nach 1516 auf den Fundamenten einer früheren Kirche, die San Martino gewidmet war, erbaut.
Mehrmals umgebaut, auch infolge der beiden Erdbeben von 1873 und 1936, beherbergt es seit 1555 die antike Taufstätte, weshalb es seit Jahrhunderten der Baptisterium der nahegelegenen Stadtkathedrale ist. 1970 wurde es umfassend saniert, wodurch die ursprünglichen Architekturmerkmale, die am Ende des 19. Jahrhunderts entstanden waren, beseitigt wurden.
Nach dem Erdbeben 1873, das zum Abriss der nahegelegenen Kirche San Andrea führte, beherbergt es die spätgotische Madonna delle Grazie aus dem 14. Jahrhundert, während seine zahlreichen Ex-voto-Tafeln (vom 15. bis zum 19. Jahrhundert) im Stadtmuseum aufbewahrt werden.
Der Restaurierungsauftrag des historischen Bauwerks, das von der Denkmalpflege überwacht wird, hatte die Absicht, die dekorativen Elemente, die am Ende des 19. Jahrhunderts an den Süd- und Westfassaden entstanden, in Erinnerung zu rufen und wiederzugeben, indem der Umfang der Bänder und dekorativen Elemente mit einem Nagel auf den Putz „markiert“ wurde, die in der fotografischen Dokumentation der Kirche nach dem Erdbeben von 1873 leicht sichtbar waren. Diese Teile wurden mit einer zarten Lasur in hellrot überzogen. Auch die Steinteile (Fensterbänke, Kanten) und die darüber befindlichen Reliefs an der Haupttür (die Taufe Christi von Giovanni Giacobini aus Belluno) sowie die beiden kleinen Glockentürme an der Südfront und alle Blecharbeiten wurden restauriert.
Im Inneren krönt ein kleiner Johannes der Täufer, ein Werk von Andrea Brustolon (1662-1732), die große Taufwanne.